団地再生支援協会は、次の組織で運営されています。
政策広報部会
諸活動の目的と方策について、官庁・業界・住民活動とのかかわりを把握し、シンポジュウム、セミナー、出版などの広報活動を管理します。
プロジェクト部会
団地再生プロジェクトの創出、事業性の評価、プロジェクト・マネージメントについて研究し、その成果を団地再生プロジェクトに生かします。
基礎研究部会
団地再生プロジェクトの実現に必要な建築再生技術、省エネルギー・緑化など様々な技術・ノウハウについて研究し、プロジェクトに提供します。